Конфедерация независимых систем в конце концов потерпела поражение, хотя оно не стало её окончательным разгромом. Неся значительные потери и при поражениях, и победах, несмотря на мощь генерала Гривуса и значительное численное превосходство, дроиды часто не справлялись с силами Республики. Но учитывая, что Дарт Сидиус манипулировал КНС, иногда лично организовывая для неё как поражения, так и победы, сепаратисты проиграли ещё до того, как начали сражаться. Поскольку обе стороны контролировались ситхом, Конфедерация также заложила основы Галактической Империи, которой в наследство от КНС достался проект «Звезды Смерти», ставшей впоследствии ужасающим супероружием Империи.